Dal 15 aprile al 24 aprile 2005 la maglia del Manfredonia Calcio ha viaggiato a bordo della Stazione Spaziale Internazionale indossata in alcune occasioni dall’astronauta italiano Roberto Vittori durante la missione Sojuz TMA-6.
Franco Cinque è il primo allenatore sipontino ad aver portato il Manfredonia in Serie D. Mentre Pompeo La Torre è l’altro allenatore di Manfredonia, ad aver vinto un torneo regionale con la squadra della propria città. La Torre era il Presidente e Allenatore della Libertas “Virgilio Maroso”, la quale, il 29 agosto del 1950 cambiò denominazione diventando Associazione Sportiva Manfredonia.
Il miglior piazzamento della storia del Manfredonia è il nono posto nel campionato di Serie C1 2006-2007 con 46 punti. Nella stagione 1951-1952 fa segnare il primato nazionale di 106 gol segnati in un solo campionato, così come si rileva dal Libro Manfredonia nel Pallone a cura di Giovanni e Giuseppe Ognissanti (ed. ASS 2014).