Franco Cinque è il primo allenatore sipontino ad aver portato il Manfredonia in Serie D. Mentre Pompeo La Torre è l’altro allenatore di Manfredonia, ad aver vinto un torneo regionale con la squadra della propria città. La Torre era il Presidente e Allenatore della Libertas “Virgilio Maroso”, la quale, il 29 agosto del 1950 cambiò denominazione diventando Associazione Sportiva Manfredonia.
Il miglior piazzamento della storia del Manfredonia è il nono posto nel campionato di Serie C1 2006-2007 con 46 punti. Nella stagione 1951-1952 fa segnare il primato nazionale di 106 gol segnati in un solo campionato, così come si rileva dal Libro Manfredonia nel Pallone a cura di Giovanni e Giuseppe Ognissanti (ed. ASS 2014).
Nel 2019, il Manfredonia Calcio è stata la squadra con la media punti più alta di tutta Italia nel corso dell’intero anno solare (2,69 punti) superiore perfino alla Juventus in Serie A